类SCC样甲氧西林敏感性金黄色葡萄球菌的基因组学分析
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文摘
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金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus, S.aureus), 作为一种常见的致病菌常可导致严重感染性疾病.金黄色葡萄球菌的主要特点是易产生耐药性.临床上运用多重PCR方法对S.aureus耐药菌株进行分型.SCC作为一种mecA基因的转运载体, 介导金黄色葡萄球菌产生耐药性.本研究报道了一株新甲氧西林敏感性金黄色葡萄球菌的全基因组序列信息, 即类SCC样MSSA463菌株, 经多重PCR方法, 该菌株被误鉴定为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌, 结果与药敏结果相冲突.为此, 运用焦磷酸测序方法完成了该菌株的全基因组测序, 并与已知金黄色葡萄球菌的基因组序列信息不同, 发现可读框(CZ049;AB037671)存在于attL, attR反向重复序列的临近下游.这些结果提示, 在金黄色葡萄球菌与其他微生物之间可能存在一种水平基因转移, 并改变了金黄色葡萄球菌对药物的敏感性, 推测attL, attR反向重复序列可能作为外源性基因的插入部位而存在. |
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来源
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中国科学. 生命科学
,2013,43(3):247-253 【核心库】
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关键词
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金黄色葡萄球菌
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金黄色葡萄球菌盒式染色体mec(SCC mec)
;
基因组学
;
焦磷酸测序
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地址
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1.
北京大学人民医院呼吸与危重症医学科, 北京, 100044
2.
中国科学院北京基因组研究所, 中国科学院基因组科学及信息重点实验室, 北京, 100029
3.
南昌大学第一附属医院呼吸科, 南昌, 330006
4.
中国检验检疫科学研究院, 北京, 100025
5.
Division of Genetics and Genomics, The Roslin Institute, University of Edinburgh, UK, Roslin, EH25 9RG
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语种
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中文 |
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文献类型
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研究性论文 |
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ISSN
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1674-7232 |
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学科
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临床医学 |
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基金
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国家高技术研究发展计划
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国家科技部重大项目
;
国家自然科学基金
;
中国科学院青年创新促进会项目
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文献收藏号
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CSCD:4790286
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参考文献 共
32
共2页
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|
1.
Hiramatsu K. Dissemination in Japanese hospitals of strains of Staphylococcus aureus heterogeneously resistant to vancomycin.
Lancet,1997,350:1670-1673
|
被引
56
次
|
|
|
|
|
2.
Vancomycin-Resistant Staphylococcus Aureus.
MMWR Morb Mortal Wkly Rep, 53,2004:322-323
|
被引
1
次
|
|
|
|
|
3.
Jones R N. ZAAPS International Surveillance Program (2007) for linezolid resistance: results from 5591 Gram-positive clinical isolates in 23 countries.
Diagn Micr Infec Dis,2009,64:191-201
|
被引
5
次
|
|
|
|
|
4.
Pantosti A. Mechanisms of antibiotic resistance in Staphylococcus aureus.
Future Microbiol,2007,2:323-334
|
被引
12
次
|
|
|
|
|
5.
Corkill J E. Detection of elements of the staphylococcal cassette chromosome (SCC) in a methicillin-susceptible (mecA gene negative) homologue of a fucidin-resistant MRSA.
J Antimicrob Chemother,2004,54:229-231
|
被引
1
次
|
|
|
|
|
6.
Holden M T. Complete genomes of two clinical Staphylococcus aureus strains: evidence for the rapid evolution of virulence and drug resistance.
Proc Natl Acad Sci USA,2004,101:9786-9791
|
被引
3
次
|
|
|
|
|
7.
Li D Z. Preliminary molecular epidemiology of the Staphylococcus aureus in lower respiratory tract infections: a multicenter study in China.
Chin Med J(Engl),2011,124:687-692
|
被引
8
次
|
|
|
|
|
8.
Margulies M. Genome sequencing in microfabricated high-density picolitre reactors.
Nature,2005,437:376-380
|
被引
275
次
|
|
|
|
|
9.
Delcher A L. Identifying bacterial genes and endosymbiont DNA with Glimmer.
Bioinformatics,2007,23:673-679
|
被引
76
次
|
|
|
|
|
10.
Bairoch A. The SWISS-PROT protein sequence data bank and its new supplement TREMBL.
Nucleic Acids Res,1996,24:21-25
|
被引
8
次
|
|
|
|
|
11.
Kanehisa M. KEGG: kyoto encyclopedia of genes and genomes.
Nucleic Acids Res,2000,28:27-30
|
被引
584
次
|
|
|
|
|
12.
Mulder N J. Inter Pro: an integrated documentation resource for protein families, domains and functional sites.
Brief Bioinform,2002,3:225-235
|
被引
8
次
|
|
|
|
|
13.
Harris M A. The Gene Ontology (GO) database and informatics resource.
Nucleic Acids Res,2004,32:D258-D261
|
被引
101
次
|
|
|
|
|
14.
Carver T J. ACT: the artemis comparison tool.
Bioinformatics,2005,21:3422-3423
|
被引
10
次
|
|
|
|
|
15.
Lindsay J A. Staphylococcus aureus: superbug, super genome?.
Trends Microbiol,2004,12:378-385
|
被引
3
次
|
|
|
|
|
16.
Hsiao A. Vibrio cholerae virulence regulator-coordinated evasion of host immunity.
Proc Natl Acad Sci USA,2006,103:14542-14547
|
被引
4
次
|
|
|
|
|
17.
Letunic I. Interactive Tree Of Life v2: online annotation and display of phylogenetic trees made easy.
Nucleic Acids Res,2011,39:W475-W478
|
被引
15
次
|
|
|
|
|
18.
Mostowy S. Cytoskeleton rearrangements during Listeria infection: clathrin and septins as new players in the game.
Cell Motil Cytoskel,2009,66:816-823
|
被引
2
次
|
|
|
|
|
19.
Wang B N. Paxillin phosphorylation: bifurcation point downstream of integrin-linked kinase (ILK) in streptococcal invasion.
Cell Microbiol,2007,9:1519-1528
|
被引
1
次
|
|
|
|
|
20.
Matsumoto H. Translocated effectors of Yersinia.
Curr Opin Microbiol,2009,12:94-100
|
被引
1
次
|
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