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生物芯片图像样点的自动识别
Automatic-identification of spots in biochip images

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文摘 样点自动识别是生物芯片信息自动提取的关键。根据样点、噪声和背景特征的关系提出一种新的自动识别方法。使用数学形态学和均值算子相结合的方法实现图像的滤波增强和背景亮度的估计；通过对功率谱的分析实现图像的倾斜校正和样点中心的网格定位；利用样点边缘亮度与均方差的特征实现样点中心和半径的校正。多幅生物芯片处理的实验证明该方法具有良好的抗噪声能力和弱信号辨识能力，能快速、准确地实现样点自动识别．
其他语种文摘 Automatic-identification of spots is the key for automatic-extracting information from biochip images. A new approach for automatic-identification is proposed based on the relations of spots, noises and backgrounds. Morphological and mean filtering was used to filter and enhance images and estimate intensity of background. Spectrum of power was used to correct tilting and perform spots gridding automatically. Considering intensity and standard deviation of edge, a new technique to correct center and radius was introduced. The approach has been tested in a variety of biochip images, and better resistant performance of noises and identification of weak signals are realized. It can automatic-identify spots quickly and accurately.
来源 光电工程 ,2006,33(3):95-100 【核心库】
关键词 生物芯片 ; 图像处理 ; 数学形态学 ; 功率谱 ; 边缘分析
地址

中国科学院光电技术研究所, 四川, 成都, 610209

语种 中文
文献类型 研究性论文
ISSN 1003-501X
学科 自动化技术、计算机技术
基金 中国科学院西部之光人才培养计划
文献收藏号 CSCD:2340057

参考文献 共 7 共1页

1.  Yue WANG. Iterative Normalization of cDNA Microarray Data[J]. IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine,2002,6(1):29-37 被引 1 次    
2.  Robert HIRATA Jr. HASHIMOTO. Proceedings of XIV Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing,2001:112-119 被引 1 次    
3.  Christopher BOWMAN. Automated analysis of gene-microarray images[A]. Proceedings of the 2002 IEEE Canadian Conference on Electrical and Computer Engineering,2002:1140-1144 被引 1 次    
4.  朱疆. DNA微阵列图象信息的自动提取. 计算机工程与应用,2004(7):84-87 被引 4 次    
5.  邓宁. 生物芯片图像分析方法的研究与应用[D]. 生物芯片图像分析方法的研究与应用[硕士学位论文],2004 被引 1 次    
6.  阮秋琦. 数字图像处理学[M]. 数字图像处理学,2001:450-455 被引 2 次    
7.  Y WEI. Circle Detection Using Improved Dynamic Generalized Hough Transform(IDGHT)[J]. Proc.IEEE Intel Symp.Geoscience and Remote Sensing,1998,2:1190-1192 被引 1 次    
引证文献 3 篇

1 胡翔宇 基于提升格形态小波的生物芯片图像增强 光电工程,2007,34(12):82-86
被引 0 次

2 胡翔宇 嵌入式生物芯片检测分析系统设计 计算机应用研究,2008,25(4):1254-1256
被引 0 次

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