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石笔木CHS基因家族成员的分析
An Analysis of CHS Gene Family Based on Tutcheria spectabilis (Theaceae)

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杨俊波 1   田欣 1   李德铢 1   顾红雅 2   杨世雄 1  
文摘 用PCR方法从石笔木(Tutcheria spectabilis Dunn)的总DNA中扩增CHS基因外显子2的部分序列以代表该基因进行研究,经克隆后测序,得到长约740-780bp的序列共12个。以EMBL数据库中得到的紫花苜蓿和欧洲赤松各一个序列作为参照,进行排序和系统树的构建分析。结果显示,所有被测定的序列同源性均高于70%,为CHS基因家庭的成员,且这些序列由3大类共5种不同的基因拷贝组成:第一类家族成员因碱基的插入和缺失改变了读码框,推测已失去了CHS基因的功能,成为假基因,其中个别拷贝存在较大缺失,这在以前的研究中未见报道;第二类家族成员因活性位点的氨基酸发生突变,可能具有新的基因功能;第三类家族成员则具有原CHS基因的功能。综上结果,可预测,山茶科CHS基因家族较大,且有着复杂的进化式样。
其他语种文摘 By using PCR method, partial sequences of chalcone synthase (CHS) gene exon 2 were amplified from genomic DNA of Tutcheria spectabilis (Theaceae). After cloning and sequencing, 12 sequences ranging from 740bp to 780bp were obtained. Comparing these sequences, with the ones of Medicago sativa and Pinus sylvestris from EMBL database, it reveals a similarity higher than 70% at the nucleotide level, and they are the members of CHS gene family. The result indicates that these sequences consist of five different gene copies in three groups. In group 1, and CHS genes lost their functions because of indels of bases, then turning into pseudo-genes, which is reported here for the first time; In group 2, the gene copies provide new functions because of the mutation of the amino acid in active sites; In group 3, the copies have the same function of CHS genes. It is suggested that the CHS gene family in Theaceae is large, which has complex evolutionary mode.
来源 云南植物研究 ,2002,24(2):209-214 【核心库】
关键词 石笔木 ; CHS基因 ; 山茶科
地址

1. 中国科学院昆明植物研究所, 云南, 昆明, 650204  

2. 北京大学生命科学学院, 北京, 100871

语种 中文
文献类型 研究性论文
ISSN 0253-2700
学科 植物学
基金 国家自然科学基金
文献收藏号 CSCD:1077968

参考文献 共 9 共1页

1.  王金玲. CHS基因外显子2的进化规律及其用于植物分子系统学研究的可行性. 科学通报,2000,45(9):942-950 被引 14    
2.  DoylZe J J. Phytochemical Bulletin,1987,19:11-15 被引 1    
3.  Feinbaum R L. Mol Cell Biol,1988,8:1985-1992 被引 9    
4.  Helariutta Y. Proc Natl Acad Sci USA,1996,93:9033-9038 被引 8    
5.  Herrmann A. Mol Gen Genet,1988,12(1):93-98 被引 7    
6.  Qu L J. Sex Plant Reprod,1997,10:181-183 被引 3    
7.  Swofford D L. PAUP: phylogenetic analysis using parsimony, Ver. 4.0b5,2000 被引 1    
8.  Ursula N K. J Mol Evol,1987,26:213-225 被引 13    
9.  Wienand U. Mol Gen Genet,1982,187:195-201 被引 4    
引证文献 3

1 Yang Junbo Molecular Composition and Evolution of the Chalcone Synthase (CHS)Gene Family in Five Species of Camellia (Theaceae) Acta Botanica Sinica,2003,45(6):659-666
被引 10

2 杨俊波 真双子叶基部类群十种植物的CHS基因家族成员分析 云南植物研究,2006,28(4):352-358
被引 1

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