基于ITS序列分析探讨杜鹃属映山红亚属的组间关系
Phylogenetic Relationship of Subgenus Tsutsusi (Rhododendron) Based on ITS Sequences
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文摘
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以叶状苞亚属的叶状苞杜鹃为外类群，以杜鹃属映山红亚属（subg.Tsutsusi)2组12种杜鹃和羊踯躅亚属（subg.Pentanthera）3种4种杜鹃的ITS区（包括5.8S rDNA)的序列了系统学分析。3个亚属的ITS区序长度范围为642－645bp。排序后ITS区的序列长度为653个位点，gap做缺失处理时，变异位点和信息位点分别占6．58％和3．68％。运用PAUP4．0软件分析，获得15个最简树，步长为75，一致性指数（CI）和维持性指数（RI）值分别为0．9333和0．9515，利用15个最简约树获取严格一致树，结果表明：1）映山红亚属为一单系类群，其内部支持率为81％；2）不支持将R.ashiroi独立成假映山红组，也不支持将R.tashiroi并入映山红组，而支持将R.tashiroi并入轮生叶组中的观点；3）支持将R.tsusiophyllum并入映山红组中的观点；4）大字杜鹃的系统位置还需进一步的研究。 |
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其他语种文摘
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The sequences of nrDNA internal transcribed spacers (ITS) (including 5.8S rDNA) of 12 spe-cies representing 2 sections of Subg. Tsutsusi and 4 species representing 3 sections of Subg. Pentantliera of Rhododendron, were analyzed to reconstruct the phylogeny of Subg. Tsutsusi and Subg. Pentantliera using parasimony methods and R. redowskianum Maxim of subg. Tlwrorlwdion as outgroup. The size of ITS re-gion within the three subgenera ranges from 642 to 645bp. The aligned length is 653 positions, which pro-vide 6.58% variable sites and 3.68% phylogenetical informative sites when gaps are treated as missing. 15 most parsimonious trees, with a length of 75 steps, consistency index ( CI) of 0.9333 and retention index ( RI) of 0.9515, were obtained. The topology of the strict consensus tree shows that: 1) Subg. Tsutsusi is a monophyletic group, the bootstrap value is 81 % ; 2) R. tashiroi is neither a member of Sect. Tsuswpsis nor that of Sect. Tsiitsusi, R. tashiroi should be a member of Sect. Brachycalyx; 3) R.t-susiophyllum is a member of Sect. Tsutxusi s 4) the phylogenetic position of R. schlippenbachii is not re-solved in this study and needs further research. |
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来源
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云南植物研究
,2002,24(3):313-320 【核心库】
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关键词
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ITS序列分析
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杜鹃属
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映山红亚属
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组间关系
;
系统发育
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地址
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中国科学院昆明植物研究所, 生物多样性和生物地理开放实验室, 云南, 昆明, 650204
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语种
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中文 |
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文献类型
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研究性论文 |
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ISSN
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0253-2700 |
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学科
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分子生物学 |
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基金
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国家自然科学基金国家杰出青年科学基金
;
中国科学院“百人计划”项目
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云南省自然科学基金
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文献收藏号
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CSCD:1077466
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参考文献 共
23
共2页
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|
1.
何明友.
中国植物志第57卷（第2分册）,1994
|
被引
3
次
|
|
|
|
|
2.
Baldwin B G.
Ann Missouri Bot Gard,1995,82:247-277
|
被引
162
次
|
|
|
|
|
3.
Chamberlain D F.
Edin J Bot,1990,47:89-200
|
被引
12
次
|
|
|
|
|
4.
Chamberlain D F.
The Genus Rhododendron, Its Classification and Synonymy,1996
|
被引
5
次
|
|
|
|
|
5.
Doyle J.
Phytochemical Bulletin,1987,19:11-15
|
被引
56
次
|
|
|
|
|
6.
洪亚平.
植物学报,2001,39(2):97-104
|
被引
1
次
|
|
|
|
|
7.
Judd W S.
Edin J Bot,1995,52:1-54
|
被引
5
次
|
|
|
|
|
8.
Kron K A.
Syst Bot,15(1):57-68
|
被引
1
次
|
|
|
|
|
9.
Kron K A.
Plant Syst Evol,1999,218:55-65
|
被引
2
次
|
|
|
|
|
10.
Kron K A.
Amer J Bot,1997,84(7):973-980
|
被引
15
次
|
|
|
|
|
11.
Kron K A.
Amer J of Bot,1999,86(9):1290-1300
|
被引
2
次
|
|
|
|
|
12.
Kron K A.
Systematic Botany,1996,21(1):17-29
|
被引
1
次
|
|
|
|
|
13.
Kurashige Y.
J Jpn Bot,1998,73:143-154
|
被引
4
次
|
|
|
|
|
14.
Philipson M N.
Notes RBG Edinb,1982,40(1):225-227
|
被引
2
次
|
|
|
|
|
15.
Sanger F.
Proceedings of the National Academy of Sciences USA,1977,74:5463-5467
|
被引
243
次
|
|
|
|
|
16.
史全良. 用ITS序列研究杨属各组之间的系统发育关系.
植物学报,2001,43(3):323-325
|
被引
23
次
|
|
|
|
|
17.
Sleumer H.
Bot Jahrb Syst,1949,74:511-553
|
被引
9
次
|
|
|
|
|
18.
Sleumer H.
Contributions Toward a Classification of Rhododendron,1980:19-26
|
被引
12
次
|
|
|
|
|
19.
Stevens P F.
Bot J Linn Sco,1971,64:1-53
|
被引
4
次
|
|
|
|
|
20.
王建波. 核rDNA的ITS序列在被子植物系统与进化研究中的应用.
植物分类学报,1999,37(4):407-416
|
被引
98
次
|
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